2017年9月1日，张灿玾因病医治无效在济南去世，享年90岁。
先后承担和完成国家中医药管理局重点课题多项，出版了《针灸甲乙经校注》、《素问吴注》、《松峰说疫》、《经穴解》、《石室秘录》点校等10多部中医古籍。
张灿玾著成具有重要学术价值的《黄帝内经文献研究》一书。曾出版《医余吟草》诗词集。
1983年，张灿玾被卫生部指定为华北山东片古籍整理学术带头人，先后承担和完成国家中医药管理局重点课题多项，出版了《针灸甲乙经校注》、《素问吴注》、《松峰说疫》、《经穴解》、《石室秘录》校点等10多部中医古籍。
1994年，张灿玾开始撰写《中医古籍文献学》，每天平均工作10多个小时，历时3年完成，全书100多万字，体现了国内外该专业的最高水平。然而，很多人却不知道，在撰写这部书的过程中，他的老伴不幸去世，他自己也由于过度劳累而复发胃肠病和颈椎病。
